Juan Rafael inició sus estudios en la Facultad de Medicina de la Universidad de Córdoba y en 1994 comenzó su etapa como médico interno residente (MIR) en oncología médica en el hospital universitario Reina Sofía, centro en el que se quedó trabajando como oncólogo médico tras acabar la especialidad en 1999. Además, lleva vinculado al hospital San Juan de Dios de Córdoba desde 2002.
Otros puestos que desempeña en la actualidad son los de coordinador de investigación clínica del Instituto Maimónides de Investigación Biomédica de Córdoba (Imibic) y de investigación en Oncología Médica del hospital Reina Sofía. Juan de la Haba, fue elegido en 2021 Cordobés del Año por Diario CÓRDOBA en la categoría de Valores Sociales. Él cree que una de las tres vertientes de su trabajo es el acompañamiento al paciente con cáncer y a su familia desde la asistencia profesional como oncólogo médico y mediante el desarrollo de proyectos como En qué te puedo ayudar, Calvas & Bellas, Viaje al corazón, Running with you, Oncotrad, entre otros.
Por otro lado, otro pilar fundamental del trabajo de este oncólogo cordobés es la generación de conocimiento que lleva a cabo a través de la investigación. Desde hace años, Juan de la Haba está colaborando y coordinando proyectos de investigación nacionales e internacionales sobre cáncer que se concretan en la autoría de 88 publicaciones científicas de alto impacto. Y otro aspecto fundamental de su trayectoria es su compromiso con las nuevas generaciones de médicos, para devolver a esos futuros doctores lo que él ha aprendido mediante su faceta como profesor titular de la Facultad de Medicina de la UCO.